發(fā)票交叉稽核子系統(tǒng)是一套對(duì)增值稅專(zhuān)用發(fā)票、公路內(nèi)河運(yùn)輸發(fā)票、機(jī)動(dòng)車(chē)銷(xiāo)售統(tǒng)一發(fā)票的記賬聯(lián)和抵扣聯(lián)比對(duì)的稅務(wù)系統(tǒng)，該系統(tǒng)是“金稅工程”的重要組成部分。

　　發(fā)票交叉稽核子系統(tǒng)的原理是將購(gòu)貨方所取得的抵扣聯(lián)和銷(xiāo)貨方的存根聯(lián)的主要內(nèi)容錄入計(jì)算機(jī)交叉稽核系統(tǒng)，系統(tǒng)將自動(dòng)在全國(guó)范圍內(nèi)對(duì)每一筆經(jīng)濟(jì)業(yè)務(wù)的抵扣聯(lián)和存根聯(lián)進(jìn)行查找配對(duì)，檢查出只有抵扣聯(lián)而沒(méi)有存根聯(lián)，或只有存根聯(lián)而沒(méi)有抵扣聯(lián)，以及抵扣聯(lián)與存根聯(lián)內(nèi)容不相符的增值稅專(zhuān)用發(fā)票，然后對(duì)這些增值稅專(zhuān)用發(fā)票進(jìn)行檢查核實(shí)，實(shí)現(xiàn)對(duì)利用增值稅專(zhuān)用發(fā)票進(jìn)行偷稅、騙稅等違法犯罪活動(dòng)的控制。